Defensa de una enorme energía que no dudaba en adelantar su posición y hacer centradas ofensivas por la banda izquierda. Era muy fuerte y capaz de resistir físicamente su juego explosivo. Formado en las categorías inferiores del club, al que se incorporó como juvenil, para formar parte finalmente de la plantilla del primer equipo durante nueve temporadas. Al dejar el club se fue al Atlético de Madrid, donde se retiró en 2005.

Sergi Barjuan debutó con el primer equipo del Barça de la mano de Johan Cruyff el 24 de noviembre de 1993 en uno de los campos más calientes de Europa, el Ali Sami Yen de Estambul. Fue en un partido de la fase de grupos de la Champions League ante el Galatasaray. El resultado final fue de empate a cero. El joven jugador de Les Franqueses convenció a su técnico y ya no volvería a jugar con el filial. Al final de temporada se proclamó campeón de Liga con el Barça, probando el éxito pero también la desilusión, ya que pocos días más tarde perdería la fatídica final de Atenas contra el Milan. La trayectoria de Sergi fue impecable como azulgrana. Jugó nueve temporadas y levantó nueve títulos oficiales. Fue dirigido por cinco técnicos: Johan Cruyff, Bobby Robson, Louis Van Gaal, Serra Ferrer y Carles Reixach. Con todos ellos fue una pieza clave. Finalmente, en verano de 2002 fichó por el Atlético de Madrid. Cosas del destino, el primer partido oficial de Sergi con los colchoneros fue contra el Barça y en el Camp Nou; en la jornada que abría el curso 2002-2003, Barça y Atlético de Madrid acabaron empatando a dos. Al cabo de tres temporadas vestido de rojiblanco, Sergi se retiró del fútbol profesional en 2005.

Palmarés:

3 Ligas (1993-1994, 1997-1998 y 1998-1999)
2 Copas (1996-1997 y 1997-1998)
1 Recopa de Europa (1996-1997)
1 Supercopa de Europa (1997-1998)
2 Supercopas de España (1994-1995 y 1997-1998)

Internacional con la selección española en 56 ocasiones